Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcirg1Q9JHF5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tcirg1Q9JHF5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tcirg1Q9JHF5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms