Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp6Q9ESX2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sp6Q9ESX2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sp6Q9ESX2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms