Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Brd4Q9ESU6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Brd4Q9ESU6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Brd4Q9ESU6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Brd4Q9ESU6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Brd4Q9ESU6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Brd4Q9ESU6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Brd4Q9ESU6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Brd4Q9ESU6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Brd4Q9ESU6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Brd4Q9ESU6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Brd4Q9ESU6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Brd4Q9ESU6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Brd4Q9ESU6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Brd4Q9ESU6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Brd4Q9ESU6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Brd4Q9ESU6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Brd4Q9ESU6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Brd4Q9ESU6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Brd4Q9ESU6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Brd4Q9ESU6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Brd4Q9ESU6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Brd4Q9ESU6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Brd4Q9ESU6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Brd4Q9ESU6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Brd4Q9ESU6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Brd4Q9ESU6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.66
Brd4Q9ESU6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Brd4Q9ESU6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Brd4Q9ESU6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Brd4Q9ESU6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Brd4Q9ESU6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Brd4Q9ESU6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Brd4Q9ESU6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Brd4Q9ESU6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Brd4Q9ESU6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Brd4Q9ESU6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Brd4Q9ESU6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Brd4Q9ESU6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Brd4Q9ESU6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Brd4Q9ESU6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Brd4Q9ESU6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Brd4Q9ESU6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Brd4Q9ESU6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Brd4Q9ESU6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Brd4Q9ESU6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Brd4Q9ESU6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Brd4Q9ESU6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Brd4Q9ESU6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Brd4Q9ESU6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Brd4Q9ESU6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Brd4Q9ESU6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Brd4Q9ESU6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Brd4Q9ESU6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Brd4Q9ESU6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Brd4Q9ESU6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Brd4Q9ESU6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Brd4Q9ESU6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Brd4Q9ESU6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Brd4Q9ESU6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Brd4Q9ESU6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Brd4Q9ESU6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Brd4Q9ESU6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Brd4Q9ESU6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Brd4Q9ESU6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Brd4Q9ESU6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Brd4Q9ESU6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Brd4Q9ESU6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Brd4Q9ESU6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Brd4Q9ESU6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Brd4Q9ESU6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Brd4Q9ESU6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Brd4Q9ESU6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Brd4Q9ESU6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Brd4Q9ESU6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Brd4Q9ESU6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Brd4Q9ESU6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Brd4Q9ESU6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Brd4Q9ESU6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Brd4Q9ESU6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC37.7■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Brd4Q9ESU6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms