Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cmtm7Q9ESD6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtm7Q9ESD6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm7Q9ESD6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms