Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERC3

Sertad3, SERTA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sertad3Q9ERC3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sertad3Q9ERC3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sertad3Q9ERC3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sertad3Q9ERC3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sertad3Q9ERC3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sertad3Q9ERC3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sertad3Q9ERC3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sertad3Q9ERC3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sertad3Q9ERC3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sertad3Q9ERC3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms