Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn12Q9ER56 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Capn12Q9ER56 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Capn12Q9ER56 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms