Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col4a3bpQ9EQG9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Col4a3bpQ9EQG9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Col4a3bpQ9EQG9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col4a3bpQ9EQG9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms