Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r48Q9EQ52 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmn1r48Q9EQ52 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r48Q9EQ52 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r48Q9EQ52 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r48Q9EQ52 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r48Q9EQ52 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r48Q9EQ52 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmn1r48Q9EQ52 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r48Q9EQ52 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmn1r48Q9EQ52 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r48Q9EQ52 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r48Q9EQ52 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms