Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP97

Senp3, Sentrin-specific protease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp3Q9EP97 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Senp3Q9EP97 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Senp3Q9EP97 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Senp3Q9EP97 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Senp3Q9EP97 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms