Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ap3s1Q9DCR2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ap3s1Q9DCR2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3s1Q9DCR2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms