Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smg9Q9DB90 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smg9Q9DB90 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg9Q9DB90 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smg9Q9DB90 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smg9Q9DB90 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg9Q9DB90 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg9Q9DB90 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg9Q9DB90 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg9Q9DB90 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg9Q9DB90 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms