Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp2aQ9DB34 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chmp2aQ9DB34 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chmp2aQ9DB34 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp2aQ9DB34 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms