Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc89Q9DA73 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc89Q9DA73 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms