Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Samd8Q9DA37 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Samd8Q9DA37 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms