Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9E0

Slc22a17, Solute carrier family 22 member 17, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a17Q9D9E0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc22a17Q9D9E0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc22a17Q9D9E0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc22a17Q9D9E0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc22a17Q9D9E0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc22a17Q9D9E0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc22a17Q9D9E0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc22a17Q9D9E0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc22a17Q9D9E0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms