Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg7Q9D906 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg7Q9D906 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg7Q9D906 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.5 ms