Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c6Q9D8P7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c6Q9D8P7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms