Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn22Q9D7U6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldn22Q9D7U6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn22Q9D7U6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms