Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tgm5Q9D7I9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tgm5Q9D7I9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tgm5Q9D7I9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tgm5Q9D7I9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tgm5Q9D7I9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tgm5Q9D7I9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tgm5Q9D7I9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tgm5Q9D7I9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tgm5Q9D7I9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tgm5Q9D7I9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tgm5Q9D7I9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.2 ms