Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpap3Q9D706 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpap3Q9D706 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpap3Q9D706 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms