Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tube1Q9D6T1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tube1Q9D6T1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tube1Q9D6T1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms