Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sdr42e1Q9D665 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sdr42e1Q9D665 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms