Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab11fip1Q9D620 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rab11fip1Q9D620 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip1Q9D620 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms