Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PudpQ9D5U5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PudpQ9D5U5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PudpQ9D5U5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PudpQ9D5U5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PudpQ9D5U5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PudpQ9D5U5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms