Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931428L18RikQ9D4S9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms