Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
4930578G10RikQ9D4Q4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930578G10RikQ9D4Q4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms