Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ribc2Q9D4Q1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ribc2Q9D4Q1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms