Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul2Q9D4H8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul2Q9D4H8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul2Q9D4H8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms