Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gcc1Q9D4H2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gcc1Q9D4H2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms