Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rsph14Q9D3W1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Rsph14Q9D3W1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms