Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Trappc6bQ9D289 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trappc6bQ9D289 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms