Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SarnpQ9D1J3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SarnpQ9D1J3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SarnpQ9D1J3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms