Protein–RNA interactions for Protein: Q9D112

Uncharacterized protein C20orf196 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D112 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D112 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q9D112 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D112 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D112 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D112 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D112 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D112 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D112 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D112 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D112 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D112 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D112 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D112 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D112 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D112 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D112 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Q9D112 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D112 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D112 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D112 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D112 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D112 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D112 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D112 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D112 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D112 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D112 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D112 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D112 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D112 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D112 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D112 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D112 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D112 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D112 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D112 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D112 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D112 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D112 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D112 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D112 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q9D112 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9D112 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9D112 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D112 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D112 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D112 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D112 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D112 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D112 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D112 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D112 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D112 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D112 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D112 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D112 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D112 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D112 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D112 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D112 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D112 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D112 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D112 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D112 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D112 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D112 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D112 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D112 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D112 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D112 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D112 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D112 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D112 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D112 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D112 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D112 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D112 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D112 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D112 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D112 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D112 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D112 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D112 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D112 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D112 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D112 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D112 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D112 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D112 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Q9D112 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D112 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D112 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D112 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D112 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D112 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D112 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D112 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D112 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D112 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 699.8 ms