Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NkapQ9D0F4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NkapQ9D0F4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NkapQ9D0F4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms