Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B8

Ribc1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc1Q9D0B8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ribc1Q9D0B8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ribc1Q9D0B8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ribc1Q9D0B8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ribc1Q9D0B8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ribc1Q9D0B8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ribc1Q9D0B8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ribc1Q9D0B8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ribc1Q9D0B8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ribc1Q9D0B8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ribc1Q9D0B8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ribc1Q9D0B8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ribc1Q9D0B8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ribc1Q9D0B8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ribc1Q9D0B8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ribc1Q9D0B8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ribc1Q9D0B8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ribc1Q9D0B8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ribc1Q9D0B8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ribc1Q9D0B8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms