Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mms19Q9D071 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mms19Q9D071 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mms19Q9D071 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms