Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Elp3Q9CZX0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Elp3Q9CZX0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Elp3Q9CZX0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Elp3Q9CZX0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Elp3Q9CZX0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Elp3Q9CZX0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Elp3Q9CZX0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Elp3Q9CZX0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Elp3Q9CZX0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Elp3Q9CZX0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Elp3Q9CZX0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Elp3Q9CZX0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Elp3Q9CZX0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Elp3Q9CZX0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Elp3Q9CZX0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Elp3Q9CZX0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Elp3Q9CZX0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Elp3Q9CZX0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Elp3Q9CZX0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Elp3Q9CZX0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms