Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CenpnQ9CZW2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CenpnQ9CZW2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CenpnQ9CZW2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms