Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab3bQ9CZT8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rab3bQ9CZT8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab3bQ9CZT8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab3bQ9CZT8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab3bQ9CZT8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab3bQ9CZT8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms