Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmss1Q9CZT6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmss1Q9CZT6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmss1Q9CZT6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmss1Q9CZT6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmss1Q9CZT6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmss1Q9CZT6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmss1Q9CZT6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmss1Q9CZT6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmss1Q9CZT6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmss1Q9CZT6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmss1Q9CZT6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmss1Q9CZT6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmss1Q9CZT6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmss1Q9CZT6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmss1Q9CZT6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmss1Q9CZT6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cmss1Q9CZT6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmss1Q9CZT6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmss1Q9CZT6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms