Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sgo1Q9CXH7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sgo1Q9CXH7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms