Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pin4Q9CWW6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pin4Q9CWW6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pin4Q9CWW6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms