Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9CRC3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9CRC3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CRC3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CRC3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9CRC3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms