Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl28Q9CR40 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl28Q9CR40 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms