Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4931417E11RikQ9CR05 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
4931417E11RikQ9CR05 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.8 ms