Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Riok2Q9CQS5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Riok2Q9CQS5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riok2Q9CQS5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms