Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nicn1Q9CQM0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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Nicn1Q9CQM0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nicn1Q9CQM0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms