Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl35Q9CQL6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl35Q9CQL6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl35Q9CQL6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms