Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmed6Q9CQG0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmed6Q9CQG0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms