Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab5aQ9CQD1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab5aQ9CQD1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab5aQ9CQD1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms